`` Найбільше '' дослідження мікробіомів впливає на здоров'я нашого кишечника
Отримані перші результати найбільшого дослідження, яке коли-небудь досліджувало мікробіом людини. Вони мають важливе значення для нашої дієтичної практики, стійкості до антибіотиків та нашого психічного здоров’я.
У 2012 році Роб Найт, доктор філософії, з Каліфорнійського університету (Сан-Дієго), Джефф Ліч, доктор філософії, засновник Проекту людської їжі, та Джек Гілберт, доктор філософії, який є директор факультету Центру мікробіомів при Чиказькому університеті в штаті Іллінойс взявся заснувати Американський проект кишечника.
Метою проекту було дізнатись більше про людський мікробіом - тобто колекцію генів, що кодують всі наші мікроби.
Зокрема, дослідники хотіли дізнатися, скільки видів бактерій мешкає в нашому тілі і де, і як наше харчування та спосіб життя впливають на склад цих мікробів.
З цією метою вони використовували так звану науку про громадян - практику, в якій громадськість робить внесок у дослідження, пропонуючи свій час та особисті дані для аналізу.
Зараз доступні перші результати проекту, і вони пропонують підказки щодо того, що робить наші кишки здоровими та бактеріально різноманітними. Висновки були опубліковані в журналі mSystems.
Громадянські вчені допомагають вивчати мікробіом
В рамках проекту учасники заплатили 99 доларів за набір для збору зразків калу, порожнини рота та шкіри бактерій.
Вони також повинні були відповісти на опитування, в якому запитували їх загальний стан здоров'я та будь-які хвороби, які вони могли мати, спосіб життя та дієти.
У 2015 році проект нарахував 15 096 зразків, наданих 11 336 особами із США, Великобританії, Австралії та 42 інших країн.
Потім дослідники використовували геномне секвенування для аналізу генетичного маркера, званого 16S рРНК, молекули, унікальної для бактерій.
Вони також вивчали набір метаболітів у зразках, щоб проаналізувати інші молекули та хімічні сполуки, які можуть бути присутніми.
Нарешті, для всебічного аналізу генетичних даних вчені використали метод, який називається метагеномікою дробовика - інноваційний та потужний метод секвенування ДНК.
Важливість різноманітної дієти на рослинній основі
По-перше, результати свідчать про те, що більш різноманітна дієта на рослинній основі робить кишку більш бактеріально різноманітною.
Зокрема, ті, хто споживав більше 30 різних видів рослин щотижня, мали набагато більше різноманітних мікробіомів, ніж ті, хто споживав лише 10 або менше видів рослин щотижня.
Однак дослідники зазначають, що ці результати не обов’язково означають, що збільшення мікробного різноманіття є позитивною справою для здоров’я когось.
По-друге, учасники, які повідомляли, що їли більше 30 видів рослин на тиждень, здавалося, мали нижчу стійкість до антибіотиків.
Дослідники виявили в зразках калу цих людей менше генів, що вказують на стійкість до антибіотиків - тобто менше генів, які допомагають бактеріям вирватися з наркотиків.
Хоча дослідження є суто спостережливим і не може зробити висновку про причинність, автори припускають, що особи, в раціоні яких міститься менше рослин, можуть компенсувати їжу або м'ясом, яке, можливо, лікували антибіотиками, або обробленою їжею, до якої додавали антибіотики .
Кишкові бактерії та психічне здоров’я
Нарешті, дослідження виявило цікаві зв’язки між складом бактерій кишечника та психічними захворюваннями.
Ті, хто повідомляв про життя з посттравматичним стресовим розладом (ПТСР), шизофренією, депресією або біполярним розладом, порівнювали зі здоровими контролерами, які відповідали віку, статі та індексу маси тіла (ІМТ).
Результати продемонстрували, що люди, які повідомляли про проблеми психічного здоров'я, мали більше спільних бактерій з іншими людьми, які повідомляли про подібні проблеми, ніж із контролем.
Ця асоціація була сильною незалежно від статі, віку чи географічного положення. Також дослідження показує, що деякі види бактерій можуть бути більш поширеними серед людей, які живуть з депресією.
Ці висновки посилюють зв'язок між психічним здоров'ям і кишковими бактеріями попередніми дослідженнями.
Наприклад, недавнє дослідження підкреслило зв'язок між тривогою та відсутністю певних здорових мікробів у кишечнику. Інший виявив, що певні бактерії змінюються у людей з ПТСР.
Назустріч „мікробіому GPS”
Даніель Макдональд, доктор філософії, науковий керівник Американського проекту кишечника в Медичній школі UC Сан-Дієго, зважує важливість висновків. Він каже:
"Ми спостерігали набагато більшу мікробну різноманітність, ніж виявили попередні менші дослідження, і це говорить про те, що якщо ми розглянемо більше популяцій, то побачимо більше різноманітності, що важливо для визначення меж людського мікробіома".
Найт дотримується подібних настроїв, кажучи: "Мікробіом людини складний, але чим більше зразків ми отримаємо, тим швидше ми зможемо розгадати безліч способів, якими мікробіом пов'язаний з різними станами здоров'я та захворювань".
"Американський проект кишечника динамічний, зразки надходять з усього світу щодня", - додає Найт.
«Аналіз, представлений у цій роботі, представляє єдиний знімок, але ми хочемо врешті-решт вийти за рамки створення карт мікробіома до створення мікробіома GPS, який повідомляє вам не просто, де ви знаходитесь на цій карті, але куди ви хочете піти і що робити робити для того, щоб дістатись з точки зору дієти, способу життя або ліків ".
Роб Найт, доктор філософії
